厦门大学生物信息学辅助药物开发研究组（Bioinformatics-Aided Drug Discovery Group）始建于2004年初。 其依托于厦门大学生命科学学院; 也是厦门大学细胞应激生物学国家重点实验室 和福建省化学生物学重点实验室的组成。

课题组主要致力于生物医药大数据的分析和计算系统药物毒理学的理论基础和应用基础研究，主要包括：（1）系统计算药物毒理学：利用系统生物学和人工智能等技术，开展药物毒副作用，尤其是临床不良反应，的分子机制理论研究和智能预测；发现药物作用新靶点、新适应症和新药物组合。（2）生物医药大数据的挖掘：通过对多模态健康医疗大数据的挖掘和机器学习，开展复杂疾病的遗传分子基础研究，发现潜在药物靶点，开发复杂疾病诊断和干预的新方法和新技术。（3）系统生物学：开发多组学数据分析的新方法和新应用，系统探索精子成熟和神经系统发育的分子机制。先后主持和参与国家自然科学基金重点项目、面上项目、国家重点研发计划项目、科技部“重大新药创制”科技重大专项等国家和省部级科研项目多项，开发十多个生物医药信息数据库和软件，并在国际主流学术期刊发表学术论文60多篇。

研究组目前拥有高性能并行计算集群、高性能计算工作站、图形工作站等硬件设备，以及一系列生物信息学与药物设计软件，可以从多层次开展生物信息学与药物研发工作。